肌肉嫩度儀：江口蘿卜豬UCP3 基因變異及其表達量與肉質(zhì)性狀關(guān)聯(lián)性分析

   2018年，貴州大學(xué)動(dòng)物科學(xué)學(xué)院研究人員在國內期刊《農業(yè)生物技術(shù)學(xué)報》在線(xiàn)發(fā)表了題為“江口蘿卜豬UCP3 基因變異及其表達量與肉質(zhì)性狀關(guān)聯(lián)性分析"的研究文章。在該論文中，研究人員使用上海騰拔儀器科技有限公司的RTA-Meat肌肉嫩度儀來(lái)測定豬肉的剪切力。

  摘要：解耦聯(lián)蛋白3 (uncoupling protein 3, UCP3)作為重要調控蛋白，主要參與機體能量代謝調節，在脂質(zhì)代謝，脂肪酸氧化和脂肪沉積中起著(zhù)重要作用，對氧化磷酸化反應途徑是否產(chǎn)生ATP起決定性作用。為研究UCP3 基因與豬肉質(zhì)性狀之間的關(guān)系，本研究測定了165 頭江口蘿卜豬(Sus scrofa) 11 項肉質(zhì)性能指標，利用混合DNA池擴增UCP3 基因全部外顯子，測序篩選SNPs 位點(diǎn)，用單個(gè)樣本DNA擴增SNPs 位點(diǎn)對應外顯子并測序，以驗證位點(diǎn)和分型，分析各位點(diǎn)不同基因型江口蘿卜豬肉質(zhì)性能差異。采用qRTPCR檢測了UCP3 基因在背最長(cháng)肌中的表達量，進(jìn)行基因型、肉質(zhì)性能以及基因表達量的相關(guān)性研究。研究結果發(fā)現了6 個(gè)SNPs 位點(diǎn)，g. 3127A>G、g. 3205T>C、g. 10439C>T、g. 10441C>A、g. 10466G>A、g.10479A>G/T。群體遺傳參數分析發(fā)現除g.10479A>G/T位點(diǎn)外的其他位點(diǎn)雜合度高，說(shuō)明群體內等位基因分布比較均勻；有效等位基因數高，表明群體內變異程度大；多態(tài)信息含量均大于0.25，為中度多態(tài)，表明位點(diǎn)可以提供一定的遺傳信息。χ2檢驗顯示6 個(gè)位點(diǎn)均極顯著(zhù)偏離Hardy-Weinberg 平衡。連鎖不平衡分析發(fā)現，g. 3127A>G 和g. 3205T>C 位點(diǎn)、g. 10439C>T 和g. 10466G>A 位點(diǎn)為*連鎖不平衡，g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A、g.10479A>G/T 之間為強連鎖不平衡。SNPs 位點(diǎn)與肉質(zhì)的關(guān)聯(lián)性分析發(fā)現g.10479A>G/T位點(diǎn)TT型和GG型個(gè)體大理石紋評分顯著(zhù)高于A(yíng)A型和AG型個(gè)體，剪切力則反之；基因型與背最長(cháng)肌中UCP3 基因表達量的關(guān)聯(lián)性分析發(fā)現，g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以及g.10479A>G/T 4 個(gè)位點(diǎn)上均為突變型個(gè)體表達量極顯著(zhù)高于另外兩種基因型；UCP3 基因在背最長(cháng)肌中的表達量與兩項肉質(zhì)指標存在極顯著(zhù)相關(guān)性，其中與剪切力負相關(guān)，與肌內脂肪含量正相關(guān)。本研究結果表明，g.10439C>T、g.10441C>A、g.10466G>A以及g.10479A>G/T位點(diǎn)為影響江口蘿卜豬肉質(zhì)性能的重要SNPs位點(diǎn)，且UCP3 基因表達量提高有利于肌內脂肪的沉積，此研究結果為篩選有助于江口蘿卜豬肌內脂肪沉積的分子標記提供了參考依據。

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